而目前已公开报道的高等植物线粒体基因组,不足个,严重滞后于核基因组学的研究。主要是因为线粒体难分离、变异大、异质性高、重复序列多等多种因素附加导致植物线粒体基因组在建库测序及生物信息分析方面都难点重重。这为后续线粒体系统发育学(遗传演化研究、基因水平转移)、表观组学(甲基化研究、RNA编辑、分子调控机制)、基因工程(细胞育性研究、基因编辑、转基因)等都造成了不利影响,所以研究植物线粒体基因组具有重要意义,发表文章也比较容易,且频频登陆顶级期刊。
集思慧远致力于将细胞器组学研究做到世界级领先水平,目前已完成叶绿体基因组测序上千例,客户发表文章百余篇。
年5月份我们又开启“万种植物线粒体基因组计划”,突破了线粒体提取、基因组组装、基因组注释等多个技术难点,已搭建出完整的生物信息分析流程。
截止目前公司已成功完成禾本科、豆科、锦葵科、葫芦科、十字花科、天南星科、槭树科等多个作物、中药材及林木物种的线粒体基因组测序,积累了丰富的经验,可为您提供国内最专业的技术服务。
如您对此方面有兴趣,欢迎来电-以下给您提供了几个研究案例,供您参考。
案例一银杏和百岁兰线粒体基因组测序分析揭示裸子植物演变的极端化
(发表期刊:MOLECULARBIOLOGYANDEVOLUTIONIF=11.)
裸子植物线粒体基因组在大小,序列保守性,共有DNA水平和功能含量方面和被子植物存在巨大差异。文章通过组装银杏和百岁兰种桃完整的线粒体基因组,并结合已发表的云杉和苏铁的线粒体基因组进行比较分析,发现苏铁和银杏拥有较小的基因组、较低的替换速率、存有数目众多的基因、内含子、编辑位点,推断这可能是祖先种子植物的特征;而百岁兰拥有更大的线粒体基因组长度,加快的替换速率、丢失了大量的基因,云杉相较更甚;进一步通过重复序列分析,发现苏铁和银杏共享大量的基因间区序列,而百岁兰几乎不与任何种子植物共享基因间区序列,这些都体现了裸子植物演化的极端化。
WenhuGuo,FelixGrewe,GinkgoandWelwitschiaMitogenomesRevealExtremeContrastsinGymnospermMitochondrialEvolution,MolecularBiologyandEvolution,Volume33,Issue6,June,Pages–,
本文编辑:佚名
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